ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Molecular dynamics simulation of a human thiopurine Smethyltransferase complexed with 6-mercaptopurine model

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Molecular dynamics simulation of a human thiopurine Smethyltransferase complexed with 6-mercaptopurine model
นักวิจัย : Wanwimon Mokmak , Sissades Tongsima , Ekachai Jenwitheesuk , วรรณวิมล หมอกมาก , ศิษเฎศ ทองสิมา , เอกชัย เจนวิถีสุข
คำค้น : Ligand , Methyltransferase , Molecular dynamics simulation , Structural changes , ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2552
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/19132
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

Human thiopurine S-methyltransferase (TPMT) is an essential protein in 6-mercaptopurine (6MP) drug metabolism. To understand the pharmacogenetics of TPMT and 6MP, X-ray co-crystal structures of TPMT complexes with S-adenosyl-L-methionine (AdoMet) and 6MP are required. However, the co-crystal structure of this complex has not been reported because 6MP is poorly water soluble. We used molecular dynamics (MD) simulation to predict the structure of the complex of human TPMT-AdoHcy(CH2)6MP, where the sulfur atoms of AdoHcy and 6MP were linked by a CH2 group. After 1300 picoseconds of MD simulation, the trajectory showed that 6MP was stabilized in the TPMT active site by formation of non-bonded interactions between 6MP and Phe40, Pro196 and Arg226 side chains of TPMT. The intersulfur distance between AdoHcy and 6MP as well as the binding modes and the interactions of our TPMT-AdoHcy model are consistent with those observed in the X-ray crystal structure of murine TPMT-AdoHcy-6MP complex. The predicted binding modes of AdoHcy and 6MP in our model are consistent with those observed in murine TPMT X-ray crystal structures, which provides structural insights into the interactions of TPMT, AdoHcy, and 6MP at the atomic level and may be used as a starting point for further study of thiopurine drug pharmacogenetics.

บรรณานุกรม :
Wanwimon Mokmak , Sissades Tongsima , Ekachai Jenwitheesuk , วรรณวิมล หมอกมาก , ศิษเฎศ ทองสิมา , เอกชัย เจนวิถีสุข . (2552). Molecular dynamics simulation of a human thiopurine Smethyltransferase complexed with 6-mercaptopurine model.
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Wanwimon Mokmak , Sissades Tongsima , Ekachai Jenwitheesuk , วรรณวิมล หมอกมาก , ศิษเฎศ ทองสิมา , เอกชัย เจนวิถีสุข . 2552. "Molecular dynamics simulation of a human thiopurine Smethyltransferase complexed with 6-mercaptopurine model".
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Wanwimon Mokmak , Sissades Tongsima , Ekachai Jenwitheesuk , วรรณวิมล หมอกมาก , ศิษเฎศ ทองสิมา , เอกชัย เจนวิถีสุข . "Molecular dynamics simulation of a human thiopurine Smethyltransferase complexed with 6-mercaptopurine model."
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2552. Print.
Wanwimon Mokmak , Sissades Tongsima , Ekachai Jenwitheesuk , วรรณวิมล หมอกมาก , ศิษเฎศ ทองสิมา , เอกชัย เจนวิถีสุข . Molecular dynamics simulation of a human thiopurine Smethyltransferase complexed with 6-mercaptopurine model. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2552.