ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Isolation and functional characterization of Spirulina D6D gene promoter: Role of a putative GntR transcription factor in transcriptional regulation of D6D gene expression

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Isolation and functional characterization of Spirulina D6D gene promoter: Role of a putative GntR transcription factor in transcriptional regulation of D6D gene expression
นักวิจัย : Sanjukta Subudhi , Pavinee Kurdrid , Apiradee Hongsthong , Matura Sirijuntarut , Supaporn Cheevadhanarak , Morakot Tanticharoen , ภาวิณี เกิดฤทธิ์ , อภิรดี หงส์ทอง , มธุรา สิริจันทรัตน์ , สุภาภรณ์ ชีวะธนรักษ์ , มรกต ตันติเจริญ
คำค้น : D6-Desaturase , Gene regulation , Promoter , Regulatory element , Spirulina platensis C1 , Transcription factor , ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2551
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/18904
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

D6-Desaturase (D6D) is a key enzyme that catalyzes the synthesis of c-linolenic acid (GLA), an essential polyunsaturated fatty acid. We report here the isolation and first functional characterization of the D6D gene promoter from Spirulina platensis C1. Functional analysis of this isolated promoter showed that the Spirulina promoter was functional in Escherichia coli. Site-specific mutation studies demonstrated that the 10 sequence (TATAAT), located at 33 bp relative to the translation start site, was essential for D6D promoter function. Temperature responsive deletion analysis studies identified the minimal core promoter within the region 51 to +1, which was sufficient for basal D6D promoter activity, and several cold-shock responsive cis-acting elements with activating and repressing activity. Electrophoretic mobility shift assay and LC–MS/MS studies demonstrated that an ‘AT-rich Inverted Repeat’ (192 to 164) served as a target-binding site for a transcriptional regulator (probably a member of the GntR family) from Spirulina. Western blot analysis studies revealed that the DNA-binding transcriptional regulator underwent phosphorylation after a temperature downshift and possibly associated with transcriptional regulation of D6D gene expression. Taken together, our results suggest complex regulation of D6D gene expression in Spirulina.

บรรณานุกรม :
Sanjukta Subudhi , Pavinee Kurdrid , Apiradee Hongsthong , Matura Sirijuntarut , Supaporn Cheevadhanarak , Morakot Tanticharoen , ภาวิณี เกิดฤทธิ์ , อภิรดี หงส์ทอง , มธุรา สิริจันทรัตน์ , สุภาภรณ์ ชีวะธนรักษ์ , มรกต ตันติเจริญ . (2551). Isolation and functional characterization of Spirulina D6D gene promoter: Role of a putative GntR transcription factor in transcriptional regulation of D6D gene expression.
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Sanjukta Subudhi , Pavinee Kurdrid , Apiradee Hongsthong , Matura Sirijuntarut , Supaporn Cheevadhanarak , Morakot Tanticharoen , ภาวิณี เกิดฤทธิ์ , อภิรดี หงส์ทอง , มธุรา สิริจันทรัตน์ , สุภาภรณ์ ชีวะธนรักษ์ , มรกต ตันติเจริญ . 2551. "Isolation and functional characterization of Spirulina D6D gene promoter: Role of a putative GntR transcription factor in transcriptional regulation of D6D gene expression".
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Sanjukta Subudhi , Pavinee Kurdrid , Apiradee Hongsthong , Matura Sirijuntarut , Supaporn Cheevadhanarak , Morakot Tanticharoen , ภาวิณี เกิดฤทธิ์ , อภิรดี หงส์ทอง , มธุรา สิริจันทรัตน์ , สุภาภรณ์ ชีวะธนรักษ์ , มรกต ตันติเจริญ . "Isolation and functional characterization of Spirulina D6D gene promoter: Role of a putative GntR transcription factor in transcriptional regulation of D6D gene expression."
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2551. Print.
Sanjukta Subudhi , Pavinee Kurdrid , Apiradee Hongsthong , Matura Sirijuntarut , Supaporn Cheevadhanarak , Morakot Tanticharoen , ภาวิณี เกิดฤทธิ์ , อภิรดี หงส์ทอง , มธุรา สิริจันทรัตน์ , สุภาภรณ์ ชีวะธนรักษ์ , มรกต ตันติเจริญ . Isolation and functional characterization of Spirulina D6D gene promoter: Role of a putative GntR transcription factor in transcriptional regulation of D6D gene expression. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2551.