ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Potential natural product discovery from microbes through a diversity-guided computational framework

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Potential natural product discovery from microbes through a diversity-guided computational framework
นักวิจัย : Eakasit Pacharawongsakda , Sunai Yokwai , Supawadee Ingsriswang , เอกสิทธิ์ พัชรวงศ์ศักดา , สุนัย ยกไว้ , สุภาวดี อิงศรีสว่าง
คำค้น : Bioactive diversity , Dendrogram , Drug discovery , Microbial collection , Natural products , Phylogenetic diversity , ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2552
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/17674
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

As the occurrence of natural compounds is related to the spatial distribution and evolution of microorganisms for biological and ecological relevance, the data integration of chemistry, geography, and phylogeny within an analytical framework is needed to make better decisions on sourcing the microbes for drug discovery. Such a framework should help researcher to decide on (a) which microorganisms are capable to produce the structurally diverse-bioactive compounds and (b) where those microbes could be found. Here, we present GIST (Geospatial Integrated Species, sites and bioactive compound relationships Tracking tool), a computational framework that could describe and compare how the chemical and genetic diversity varied among microbes in different areas. GIST mainly exploits the measures of bioactive diversity (BD) and phylogenetic diversity (PD), derived from the branch length of bioactive dendrogram and phylogenetic tree, respectively. Based on BD and PD, our framework could provide guidance and tools for measuring, monitoring, and evaluating of patterns and changes in biodiversity of microorganisms to improve the success rate of drug discovery.

บรรณานุกรม :
Eakasit Pacharawongsakda , Sunai Yokwai , Supawadee Ingsriswang , เอกสิทธิ์ พัชรวงศ์ศักดา , สุนัย ยกไว้ , สุภาวดี อิงศรีสว่าง . (2552). Potential natural product discovery from microbes through a diversity-guided computational framework.
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Eakasit Pacharawongsakda , Sunai Yokwai , Supawadee Ingsriswang , เอกสิทธิ์ พัชรวงศ์ศักดา , สุนัย ยกไว้ , สุภาวดี อิงศรีสว่าง . 2552. "Potential natural product discovery from microbes through a diversity-guided computational framework".
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Eakasit Pacharawongsakda , Sunai Yokwai , Supawadee Ingsriswang , เอกสิทธิ์ พัชรวงศ์ศักดา , สุนัย ยกไว้ , สุภาวดี อิงศรีสว่าง . "Potential natural product discovery from microbes through a diversity-guided computational framework."
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2552. Print.
Eakasit Pacharawongsakda , Sunai Yokwai , Supawadee Ingsriswang , เอกสิทธิ์ พัชรวงศ์ศักดา , สุนัย ยกไว้ , สุภาวดี อิงศรีสว่าง . Potential natural product discovery from microbes through a diversity-guided computational framework. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2552.