ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Discovery of insect-specific polyketide synthases, potential PKS-NRPS hybrids, and novel PKS clades in tropical fungi

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Discovery of insect-specific polyketide synthases, potential PKS-NRPS hybrids, and novel PKS clades in tropical fungi
นักวิจัย : Alongkorn Amnuaykanjanasin , Suranat Ponghanphot , Nattapong Sengpanich , Supapon Cheevadhanarak , Morakot Tanticharoen , อลงกรณ์ อำนวยกาญจนสิน , สุรณัฐ พงษ์หาญพจน์ , ณัฐพงษ์ เส็งพานิช , สุภาภรณ์ ชีวธนรักษ์ , มรกต ตันติเจริญ
คำค้น : Fungi , Insect , Molecular genetics , PCR , PKS clade , PKS-NRPS hybrid , Polyketide synthase , Primer , ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2552
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/17644
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

Polyketides draw much attention because of their potential use in pharmaceutical and biotechnological applications. This study identifies an abundant pool of polyketide synthase (PKS) genes from local isolates of tropical fungi found in Thailand in three different ecological niches: insect pathogens, marine inhabitants, and lichen mutualists. We detected 149 PKS genes from 48 fungi using PCR with PKS-specific degenerate primers. We identified and classified 283 additional PKS genes from 13 fungal genomes. Phylogenetic analysis of all these PKS sequences comprising ketosynthase (KS) conserved region and KS-acyltransferase interdomain region yielded very similar results to phylogenies of KS domain and suggested a number of remarkable points. (a) Twelve PKS genes amplified from 12 different insect-pathogenic fungi form a tight cluster, although along with two PKS genes extracted from genomes of Aspergillus niger and A. terreus, in reducing clade III. Some of these insect-specific fungal PKSs are nearly identical. (b) We identified 38 new PKS-NRPS hybrid genes in reducing clade II. (c) Four distinct clades were discovered with more than 75% bootstrap support. We propose to designate the novel clade D1 with 100% bootstrap support as "Reducing Clade V". The newly cloned PKS genes from these tropical fungi would provide useful and diverse genetic resources for future research on the characterization of PK compounds synthesized by these enzymes.

บรรณานุกรม :
Alongkorn Amnuaykanjanasin , Suranat Ponghanphot , Nattapong Sengpanich , Supapon Cheevadhanarak , Morakot Tanticharoen , อลงกรณ์ อำนวยกาญจนสิน , สุรณัฐ พงษ์หาญพจน์ , ณัฐพงษ์ เส็งพานิช , สุภาภรณ์ ชีวธนรักษ์ , มรกต ตันติเจริญ . (2552). Discovery of insect-specific polyketide synthases, potential PKS-NRPS hybrids, and novel PKS clades in tropical fungi.
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Alongkorn Amnuaykanjanasin , Suranat Ponghanphot , Nattapong Sengpanich , Supapon Cheevadhanarak , Morakot Tanticharoen , อลงกรณ์ อำนวยกาญจนสิน , สุรณัฐ พงษ์หาญพจน์ , ณัฐพงษ์ เส็งพานิช , สุภาภรณ์ ชีวธนรักษ์ , มรกต ตันติเจริญ . 2552. "Discovery of insect-specific polyketide synthases, potential PKS-NRPS hybrids, and novel PKS clades in tropical fungi".
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Alongkorn Amnuaykanjanasin , Suranat Ponghanphot , Nattapong Sengpanich , Supapon Cheevadhanarak , Morakot Tanticharoen , อลงกรณ์ อำนวยกาญจนสิน , สุรณัฐ พงษ์หาญพจน์ , ณัฐพงษ์ เส็งพานิช , สุภาภรณ์ ชีวธนรักษ์ , มรกต ตันติเจริญ . "Discovery of insect-specific polyketide synthases, potential PKS-NRPS hybrids, and novel PKS clades in tropical fungi."
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2552. Print.
Alongkorn Amnuaykanjanasin , Suranat Ponghanphot , Nattapong Sengpanich , Supapon Cheevadhanarak , Morakot Tanticharoen , อลงกรณ์ อำนวยกาญจนสิน , สุรณัฐ พงษ์หาญพจน์ , ณัฐพงษ์ เส็งพานิช , สุภาภรณ์ ชีวธนรักษ์ , มรกต ตันติเจริญ . Discovery of insect-specific polyketide synthases, potential PKS-NRPS hybrids, and novel PKS clades in tropical fungi. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2552.