ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Antilipopolysaccharide factor (ALF) of mud crab Scylla paramamosain: Molecular cloning, genomic organization and the antimicrobial activity of its synthetic LPS binding domain

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Antilipopolysaccharide factor (ALF) of mud crab Scylla paramamosain: Molecular cloning, genomic organization and the antimicrobial activity of its synthetic LPS binding domain
นักวิจัย : Chanprapa Imjongjirak , Piti Amparyup , Anchalee Tassanakajon , Siriporn Sittipraneed , จันทร์ประภา อิ่มจงใจรัก , ปิติ อ่ำพายัพ , อัญชลี ทัศนาขจร , ศิริพร สิทธิประณีต
คำค้น : Antilipopolysaccharide factor , Antimicrobial peptides , Biological sciences , Biology and biochemistry , LPS binding domain , Molecular biology , Mud crab , Scyllaparamamosain , ปูทะเล , ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ , สาขาวิทยาศาสตร์เคมีและเภสัช , เปปไทด์ต้านจุลชีพ
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2550
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/17350
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

Antilipopolysaccharide factors (ALFs) are small basic proteins that can bind and neutralize lipopolysaccharide (LPS) and have broad spectrum antimicrobial activities. In this study, we describe the isolation of the full-length cDNA encoding for ALF peptide (ALFSp) of mud crab, Scylla paramamosain by sequencing a hemocyte cDNA library and using the rapid amplification cDNA end (RACE) method. A full-length ALFSp cDNA of 614 bp contains an open reading frame (ORF) of 372 bp, encoding 123 amino acid protein with 26 residues signal sequence. The calculated molecular mass of the mature protein is 11.18 kDa. The highly two conserve cysteine residues and putative LPS binding domain were observed in ALFSp peptide. Comparison of amino acid sequences revealed that ALFSp shared high identity with other known ALFs and had an overall similarity of 65, 64, 63, 61 and 59% to those of Fenneropenaeus chinensis, Litopenaeus vannamei, Marsupenaeus japonicus, Limulus polyphemus, and Tachypleus tridentatus, respectively. A neighbour-joining tree showed a clear differentiation of each species and also indicated that ALF from S. paramamosain, Carcinus maenas and Callinectes sapidus are closely related phylogenetically. The genomic DNA sequence of ALFSp gene consists of 1075 bp containing three exons and two introns. Tissue distribution analysis revealed that ALFSp was abundantly expressed in hemocytes, intestine, and muscle but not in eyestalk. The synthetic ALFSp peptide containing putative LPS binding domain revealed a strong antimicrobial activity against several bacteria especially on the growth of Gram-positive bacteria, Micrococcus luteus and Gram-negative bacteria, Vibrio harveyi suggested that ALFSp could play an essential role in defense mechanism in S. paramamosain.

บรรณานุกรม :
Chanprapa Imjongjirak , Piti Amparyup , Anchalee Tassanakajon , Siriporn Sittipraneed , จันทร์ประภา อิ่มจงใจรัก , ปิติ อ่ำพายัพ , อัญชลี ทัศนาขจร , ศิริพร สิทธิประณีต . (2550). Antilipopolysaccharide factor (ALF) of mud crab Scylla paramamosain: Molecular cloning, genomic organization and the antimicrobial activity of its synthetic LPS binding domain.
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Chanprapa Imjongjirak , Piti Amparyup , Anchalee Tassanakajon , Siriporn Sittipraneed , จันทร์ประภา อิ่มจงใจรัก , ปิติ อ่ำพายัพ , อัญชลี ทัศนาขจร , ศิริพร สิทธิประณีต . 2550. "Antilipopolysaccharide factor (ALF) of mud crab Scylla paramamosain: Molecular cloning, genomic organization and the antimicrobial activity of its synthetic LPS binding domain".
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Chanprapa Imjongjirak , Piti Amparyup , Anchalee Tassanakajon , Siriporn Sittipraneed , จันทร์ประภา อิ่มจงใจรัก , ปิติ อ่ำพายัพ , อัญชลี ทัศนาขจร , ศิริพร สิทธิประณีต . "Antilipopolysaccharide factor (ALF) of mud crab Scylla paramamosain: Molecular cloning, genomic organization and the antimicrobial activity of its synthetic LPS binding domain."
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2550. Print.
Chanprapa Imjongjirak , Piti Amparyup , Anchalee Tassanakajon , Siriporn Sittipraneed , จันทร์ประภา อิ่มจงใจรัก , ปิติ อ่ำพายัพ , อัญชลี ทัศนาขจร , ศิริพร สิทธิประณีต . Antilipopolysaccharide factor (ALF) of mud crab Scylla paramamosain: Molecular cloning, genomic organization and the antimicrobial activity of its synthetic LPS binding domain. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2550.