ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Intra-host diversities of receptor binding domain of stork feces-derived avian H5N1 viruses and its significance predicted by molecular dynamic simulation

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Intra-host diversities of receptor binding domain of stork feces-derived avian H5N1 viruses and its significance predicted by molecular dynamic simulation
นักวิจัย : Sukathida Ubol , Ampa Suksatu , Naphak Modhiran , Chak Sangma , Mark Fukuda , Arunee Thitithanyanont , Tada Juthayothin , ธาดา จูฑะโยธิน , ศุขธิดา อุบล , อัมพา สุขสาธุ , จักร แสงมา
คำค้น : Avian H5N1 viruses , Haemagglutinin gene , Molecular dynamics simulation , ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2554
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/15784
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

Viral evolution facilitates the emergence of viruses with unpredictable impacts on human health. We investigated the intra-host variations of receptor-binding domain, RBD, in HA gene of the avian H5N1 viruses obtained from 2004 and 2005 epidemics. The result showed that the mutation frequency of RBD ranged from 0.3-0.6 %. This mutation generated one consensus and several minor populations. The consensus population of 2004 epidemic was transmitted into the 2005 outbreak with increasing frequency, 39% to 45%, respectively. MD simulation was applied to predict the significance of variants. Results revealed that the consensus sequence (E218K/V248I) interacted unstably with the SAα2,6Gal. While K140R/E218K/V248I and Y191C/E218K/V248I sequences decreased HA binding capacity to α2,3-linked SA, they were shown to bind α2,6-linked SA with increased affinity. Moreover, 140 and 191 substitutions are positive-selection sites. Our data suggested that K140R and Y191C mutations may represent a step toward human adaptation of the avian H5N1 virus.

บรรณานุกรม :
Sukathida Ubol , Ampa Suksatu , Naphak Modhiran , Chak Sangma , Mark Fukuda , Arunee Thitithanyanont , Tada Juthayothin , ธาดา จูฑะโยธิน , ศุขธิดา อุบล , อัมพา สุขสาธุ , จักร แสงมา . (2554). Intra-host diversities of receptor binding domain of stork feces-derived avian H5N1 viruses and its significance predicted by molecular dynamic simulation.
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Sukathida Ubol , Ampa Suksatu , Naphak Modhiran , Chak Sangma , Mark Fukuda , Arunee Thitithanyanont , Tada Juthayothin , ธาดา จูฑะโยธิน , ศุขธิดา อุบล , อัมพา สุขสาธุ , จักร แสงมา . 2554. "Intra-host diversities of receptor binding domain of stork feces-derived avian H5N1 viruses and its significance predicted by molecular dynamic simulation".
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Sukathida Ubol , Ampa Suksatu , Naphak Modhiran , Chak Sangma , Mark Fukuda , Arunee Thitithanyanont , Tada Juthayothin , ธาดา จูฑะโยธิน , ศุขธิดา อุบล , อัมพา สุขสาธุ , จักร แสงมา . "Intra-host diversities of receptor binding domain of stork feces-derived avian H5N1 viruses and its significance predicted by molecular dynamic simulation."
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2554. Print.
Sukathida Ubol , Ampa Suksatu , Naphak Modhiran , Chak Sangma , Mark Fukuda , Arunee Thitithanyanont , Tada Juthayothin , ธาดา จูฑะโยธิน , ศุขธิดา อุบล , อัมพา สุขสาธุ , จักร แสงมา . Intra-host diversities of receptor binding domain of stork feces-derived avian H5N1 viruses and its significance predicted by molecular dynamic simulation. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2554.