ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

The chloroplast genome sequence of mungbean (Vigna radiata) determined by high throughput pyrosequencing: structural organization and phylogenetic relationships

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : The chloroplast genome sequence of mungbean (Vigna radiata) determined by high throughput pyrosequencing: structural organization and phylogenetic relationships
นักวิจัย : Sithichoke Tangphatsornruang , Duangjai Sangsrakru , Juntima Chanprasert , P. Uthaipaisanwong , Thippawan Yoocha , Nukoon Jomchai , Somvong Traogonrung , สิทธิโชค ตั้งภัสสรเรือง , ดวงใจ แสงสระคู , จันทิมา ชาญประเสริฐ , พิชาภัค อุทัยไพศาลวงศ์ , ทิพวัลย์ อยู่ชา , นุกูล จอมชัย , สม วงษ์ตระกูลรุ่ง
คำค้น : 454 pyrosequencing , Chloroplast , Chloroplast genome , Mungbean , Plant molecular biology , Plastid genome sequence , ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2553
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/15340
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

Mungbean is an economically important crop which is grown principally for its protein-rich dry seeds. However, genomic research of mungbean has lagged behind other species in the Fabaceae family. Here, we reported the complete chloroplast genome sequence of mungbean obtained by the 454 pyrosequencing technology. The mungbean chloroplast genome is 151,271 bp in length which includes a pair of inverted repeats of 26,474 bp separated by a small single copy region of 17,427 bp and a large single copy region of 80,896 bp. The genome contains 108 unique genes and 19 of these genes are duplicated in the inverted repeat (IR). Of these, 75 are predicted protein-coding genes, 4 ribosomal RNA genes and 29 tRNA genes. Relative to other plant chloroplast genomes, we observed 2 distinct rearrangements: a 50-kb inversion between accD/rps16 and rbcL/trnK-UUU, and a 78-kb rearrangement between trnH/rpl14 and rps19/rps8. We detected sequence length polymorphism in the chloroplast homopolymeric regions at the intra- and inter-specific levels in the Vigna species. Phylogenetic analysis demonstrated a close relationship between Vigna and Phaseolus in the phaseolinae subtribe and provided a strong support for a monophyletic group of the eurosid I.

บรรณานุกรม :
Sithichoke Tangphatsornruang , Duangjai Sangsrakru , Juntima Chanprasert , P. Uthaipaisanwong , Thippawan Yoocha , Nukoon Jomchai , Somvong Traogonrung , สิทธิโชค ตั้งภัสสรเรือง , ดวงใจ แสงสระคู , จันทิมา ชาญประเสริฐ , พิชาภัค อุทัยไพศาลวงศ์ , ทิพวัลย์ อยู่ชา , นุกูล จอมชัย , สม วงษ์ตระกูลรุ่ง . (2553). The chloroplast genome sequence of mungbean (Vigna radiata) determined by high throughput pyrosequencing: structural organization and phylogenetic relationships.
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Sithichoke Tangphatsornruang , Duangjai Sangsrakru , Juntima Chanprasert , P. Uthaipaisanwong , Thippawan Yoocha , Nukoon Jomchai , Somvong Traogonrung , สิทธิโชค ตั้งภัสสรเรือง , ดวงใจ แสงสระคู , จันทิมา ชาญประเสริฐ , พิชาภัค อุทัยไพศาลวงศ์ , ทิพวัลย์ อยู่ชา , นุกูล จอมชัย , สม วงษ์ตระกูลรุ่ง . 2553. "The chloroplast genome sequence of mungbean (Vigna radiata) determined by high throughput pyrosequencing: structural organization and phylogenetic relationships".
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Sithichoke Tangphatsornruang , Duangjai Sangsrakru , Juntima Chanprasert , P. Uthaipaisanwong , Thippawan Yoocha , Nukoon Jomchai , Somvong Traogonrung , สิทธิโชค ตั้งภัสสรเรือง , ดวงใจ แสงสระคู , จันทิมา ชาญประเสริฐ , พิชาภัค อุทัยไพศาลวงศ์ , ทิพวัลย์ อยู่ชา , นุกูล จอมชัย , สม วงษ์ตระกูลรุ่ง . "The chloroplast genome sequence of mungbean (Vigna radiata) determined by high throughput pyrosequencing: structural organization and phylogenetic relationships."
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2553. Print.
Sithichoke Tangphatsornruang , Duangjai Sangsrakru , Juntima Chanprasert , P. Uthaipaisanwong , Thippawan Yoocha , Nukoon Jomchai , Somvong Traogonrung , สิทธิโชค ตั้งภัสสรเรือง , ดวงใจ แสงสระคู , จันทิมา ชาญประเสริฐ , พิชาภัค อุทัยไพศาลวงศ์ , ทิพวัลย์ อยู่ชา , นุกูล จอมชัย , สม วงษ์ตระกูลรุ่ง . The chloroplast genome sequence of mungbean (Vigna radiata) determined by high throughput pyrosequencing: structural organization and phylogenetic relationships. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2553.