ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Hypomethylation of Intragenic LINE-1 Represses Transcription in Cancer Cells through AGO2

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Hypomethylation of Intragenic LINE-1 Represses Transcription in Cancer Cells through AGO2
นักวิจัย : Chatchawit Aporntewan , Chumpol Ngamphiw , Chupong Ittiwut , Sissades Tongsima , Apiwat Mutirangura , ชัชวิทย์ อาภรณ์เทวัญ , ชูพงศ์ อิทธิวุฒิ , ชุมพล งามผิว , ศิษเฎศ ทองสิมา , อภิวัฒน์ มุทิรางกูร
คำค้น : AGO2 , Biology , Cancer , Clinical medicine , DNA methylation , EIF2C2 , genome wide hypomethylation , LINE-1 , long interspersed nuclear element-1 , Medical genetics , siRNA , tumor suppressor , จีโนม , มะเร็ง , ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ , สาขาวิทยาศาสตร์เคมีและเภสัช
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2554
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/13819
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

In human cancers, the methylation of long interspersed nuclear element -1 (LINE-1 or L1) retrotransposons is reduced. This occurs within the context of genome wide hypomethylation, and although it is common, its role is poorly understood. L1s are widely distributed both inside and outside of genes, intragenic and intergenic, respectively. Interestingly, the insertion of active full-length L1 sequences into host gene introns disrupts gene expression. Here, we evaluated if intragenic L1 hypomethylation influences their host gene expression in cancer. First, we extracted data from L1base (http://l1base. molgen.mpg.de), a database containing putatively active L1 insertions, and compared intragenic and intergenic L1 characters. We found that intragenic L1 sequences have been conserved across evolutionary time with respect to transcriptional activity and CpG dinucleotide sites for mammalian DNA methylation. Then, we compared regulated mRNA levels of cells from two different experiments available from Gene Expression Omnibus (GEO), a database repository of high throughput gene expression data, (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo) by chi-square. The odds ratio of down-regulated genes between demethylated normal bronchial epithelium and lung cancer was high (p,1E227; OR = 3.14; 95% CI = 2.54– 3.88), suggesting cancer genome wide hypomethylation down-regulating gene expression. Comprehensive analysis between L1 locations and gene expression showed that expression of genes containing L1s had a significantly higher likelihood to be repressed in cancer and hypomethylated normal cells. In contrast, many mRNAs derived from genes containing L1s are elevated in Argonaute 2 (AGO2 or EIF2C2)-depleted cells. Hypomethylated L1s increase L1 mRNA levels. Finally, we found that AGO2 targets intronic L1 pre-mRNA complexes and represses cancer genes. These findings represent one of the mechanisms of cancer genome wide hypomethylation altering gene expression. Hypomethylated intragenic L1s are a nuclear siRNA mediated cis-regulatory element that can repress genes. This epigenetic regulation of retrotransposons likely influences many aspects of genomic biology.

บรรณานุกรม :
Chatchawit Aporntewan , Chumpol Ngamphiw , Chupong Ittiwut , Sissades Tongsima , Apiwat Mutirangura , ชัชวิทย์ อาภรณ์เทวัญ , ชูพงศ์ อิทธิวุฒิ , ชุมพล งามผิว , ศิษเฎศ ทองสิมา , อภิวัฒน์ มุทิรางกูร . (2554). Hypomethylation of Intragenic LINE-1 Represses Transcription in Cancer Cells through AGO2.
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Chatchawit Aporntewan , Chumpol Ngamphiw , Chupong Ittiwut , Sissades Tongsima , Apiwat Mutirangura , ชัชวิทย์ อาภรณ์เทวัญ , ชูพงศ์ อิทธิวุฒิ , ชุมพล งามผิว , ศิษเฎศ ทองสิมา , อภิวัฒน์ มุทิรางกูร . 2554. "Hypomethylation of Intragenic LINE-1 Represses Transcription in Cancer Cells through AGO2".
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Chatchawit Aporntewan , Chumpol Ngamphiw , Chupong Ittiwut , Sissades Tongsima , Apiwat Mutirangura , ชัชวิทย์ อาภรณ์เทวัญ , ชูพงศ์ อิทธิวุฒิ , ชุมพล งามผิว , ศิษเฎศ ทองสิมา , อภิวัฒน์ มุทิรางกูร . "Hypomethylation of Intragenic LINE-1 Represses Transcription in Cancer Cells through AGO2."
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2554. Print.
Chatchawit Aporntewan , Chumpol Ngamphiw , Chupong Ittiwut , Sissades Tongsima , Apiwat Mutirangura , ชัชวิทย์ อาภรณ์เทวัญ , ชูพงศ์ อิทธิวุฒิ , ชุมพล งามผิว , ศิษเฎศ ทองสิมา , อภิวัฒน์ มุทิรางกูร . Hypomethylation of Intragenic LINE-1 Represses Transcription in Cancer Cells through AGO2. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2554.