ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Particular interaction between pyrimethamine derivatives and quadruple mutant type dihydrofolate reductase of Plasmodium falciparum: CoMFA and quantum chemical calculations studies

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Particular interaction between pyrimethamine derivatives and quadruple mutant type dihydrofolate reductase of Plasmodium falciparum: CoMFA and quantum chemical calculations studies
นักวิจัย : Phornphimon Maitarad , Patchreenart Saparpakorn , Supa Hannongbua , Sumalee Kamchonwongpaisan , Bongkoch Tarnchompoo , Yongyuth Yuthavong , สุมาลี กำจรวงศ์ไพศาล , บงกช ธารชมพู , ยงยุทธ ยุทธวงศ์ , พรพิมล ไมตรัตน์ , พัชรีนารถ ทรัพย์อาภากร , สุภา หารหนองบัว
คำค้น : Bioinformatics , Computational biotechnology , Pyrimethamine , ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2552
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/13747
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

Comparative molecular field analysis (CoMFA) was performed on twenty-three pyrimethamine (pyr) derivatives active against quadruple mutant type (Asn51Ile, Cys59Arg, Ser108Asn, Ile164Leu) dihydrofolate reductase of Plasmodium falcipaarum (PfDHFR). The represented CoMFA models were evaluated based on the various three different probe atoms, C(sp3) (+1), O(sp3) (-1) and H (+1), resulting in the best model with combined three types of probe atoms. The statistical results were r(2)(cv) = 0.702, S(press) = 0.608, r(2)(nv) = 0.980, s = 0.156, and r(2)(test-set) = 0.698 which can explain steric contribution of about 50%. In addition, an understanding of particular interaction energy between inhibitor and surrounding residues in the binding pocket was performed by using MP2/6-31G(d,p) quantum chemical calculations. The obtained results clearly demonstrate that Asn108 is the cause of pyr resistance with the highest repulsive interaction energy. Therefore, CoMFA and particular interaction energy analyses can be useful for identifying the structural features of potent pyr derivatives active against quadruple mutant type PfDHFR.

บรรณานุกรม :
Phornphimon Maitarad , Patchreenart Saparpakorn , Supa Hannongbua , Sumalee Kamchonwongpaisan , Bongkoch Tarnchompoo , Yongyuth Yuthavong , สุมาลี กำจรวงศ์ไพศาล , บงกช ธารชมพู , ยงยุทธ ยุทธวงศ์ , พรพิมล ไมตรัตน์ , พัชรีนารถ ทรัพย์อาภากร , สุภา หารหนองบัว . (2552). Particular interaction between pyrimethamine derivatives and quadruple mutant type dihydrofolate reductase of Plasmodium falciparum: CoMFA and quantum chemical calculations studies.
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Phornphimon Maitarad , Patchreenart Saparpakorn , Supa Hannongbua , Sumalee Kamchonwongpaisan , Bongkoch Tarnchompoo , Yongyuth Yuthavong , สุมาลี กำจรวงศ์ไพศาล , บงกช ธารชมพู , ยงยุทธ ยุทธวงศ์ , พรพิมล ไมตรัตน์ , พัชรีนารถ ทรัพย์อาภากร , สุภา หารหนองบัว . 2552. "Particular interaction between pyrimethamine derivatives and quadruple mutant type dihydrofolate reductase of Plasmodium falciparum: CoMFA and quantum chemical calculations studies".
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Phornphimon Maitarad , Patchreenart Saparpakorn , Supa Hannongbua , Sumalee Kamchonwongpaisan , Bongkoch Tarnchompoo , Yongyuth Yuthavong , สุมาลี กำจรวงศ์ไพศาล , บงกช ธารชมพู , ยงยุทธ ยุทธวงศ์ , พรพิมล ไมตรัตน์ , พัชรีนารถ ทรัพย์อาภากร , สุภา หารหนองบัว . "Particular interaction between pyrimethamine derivatives and quadruple mutant type dihydrofolate reductase of Plasmodium falciparum: CoMFA and quantum chemical calculations studies."
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2552. Print.
Phornphimon Maitarad , Patchreenart Saparpakorn , Supa Hannongbua , Sumalee Kamchonwongpaisan , Bongkoch Tarnchompoo , Yongyuth Yuthavong , สุมาลี กำจรวงศ์ไพศาล , บงกช ธารชมพู , ยงยุทธ ยุทธวงศ์ , พรพิมล ไมตรัตน์ , พัชรีนารถ ทรัพย์อาภากร , สุภา หารหนองบัว . Particular interaction between pyrimethamine derivatives and quadruple mutant type dihydrofolate reductase of Plasmodium falciparum: CoMFA and quantum chemical calculations studies. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2552.