ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Characterization of the complete chloroplast genome of Hevea brasiliensis reveals genome rearrangement, RNA editing sites and phylogenetic relationships

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Characterization of the complete chloroplast genome of Hevea brasiliensis reveals genome rearrangement, RNA editing sites and phylogenetic relationships
นักวิจัย : Sithichoke Tangphatsornruang , Pichahpuk Uthaipaisanwong , Duangjai Sangsrakru , Juntima Chanprasert , Thippawan Yoocha , Nukoon Jomchai , Somvong Traogonrung , สิทธิโชค ตั้งภัสสรเรือง , พิชาภัค อุทัยไพศาลวงศ์ , ดวงใจ แสงสระคู , จันทิมา ชาญประเสริฐ , ทิพวัลย์ อยู่ชา , นุกูล จอมชัย , สม วงษ์ตระกูลรุ่ง
คำค้น : Biological sciences , Chloroplast , Chloroplast genome , Genome sequence , Hevea brasiliensis , Plant biotechnology and related agricultural science , Plant genetics , Protein-coding gene , Rubber , ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ , สาขาเกษตรศาสตร์และชีววิทยา
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2554
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/13702
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

Rubber tree (Hevea brasiliensis) is an economical plant and widely grown for natural rubber production. However, genomic research of rubber tree has lagged behind other species in the Euphorbiaceae family. We report the complete chloroplast genome sequence of rubber tree as being 161,191 bp in length including a pair of inverted repeats of 26,810 bp separated by a small single copy region of 18,362 bp and a large single copy region of 89,209 bp. The chloroplast genome contains 112 unique genes, 16 of which are duplicated in the inverted repeat. Of the 112 unique genes, 78 are predicted protein-coding genes, 4 are ribosomal RNA genes and 30 are tRNA genes. Relative to other plant chloroplast genomes, we observed a unique rearrangement in the rubber tree chloroplast genome: a 30-kb inversion between the trnE(UUC)-trnS(GCU) and the trnT(GGU)-trnR(UCU). A comparison between the rubber tree chloroplast genes and cDNA sequences revealed 51 RNA editing sites in which most (48 sites) were located in 26 protein coding genes and the other 3 sites were in introns. Phylogenetic analysis based on chloroplast genes demonstrated a close relationship between Hevea and Manihot in Euphorbiaceae and provided a strong support for a monophyletic group of the eurosid I.

บรรณานุกรม :
Sithichoke Tangphatsornruang , Pichahpuk Uthaipaisanwong , Duangjai Sangsrakru , Juntima Chanprasert , Thippawan Yoocha , Nukoon Jomchai , Somvong Traogonrung , สิทธิโชค ตั้งภัสสรเรือง , พิชาภัค อุทัยไพศาลวงศ์ , ดวงใจ แสงสระคู , จันทิมา ชาญประเสริฐ , ทิพวัลย์ อยู่ชา , นุกูล จอมชัย , สม วงษ์ตระกูลรุ่ง . (2554). Characterization of the complete chloroplast genome of Hevea brasiliensis reveals genome rearrangement, RNA editing sites and phylogenetic relationships.
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Sithichoke Tangphatsornruang , Pichahpuk Uthaipaisanwong , Duangjai Sangsrakru , Juntima Chanprasert , Thippawan Yoocha , Nukoon Jomchai , Somvong Traogonrung , สิทธิโชค ตั้งภัสสรเรือง , พิชาภัค อุทัยไพศาลวงศ์ , ดวงใจ แสงสระคู , จันทิมา ชาญประเสริฐ , ทิพวัลย์ อยู่ชา , นุกูล จอมชัย , สม วงษ์ตระกูลรุ่ง . 2554. "Characterization of the complete chloroplast genome of Hevea brasiliensis reveals genome rearrangement, RNA editing sites and phylogenetic relationships".
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Sithichoke Tangphatsornruang , Pichahpuk Uthaipaisanwong , Duangjai Sangsrakru , Juntima Chanprasert , Thippawan Yoocha , Nukoon Jomchai , Somvong Traogonrung , สิทธิโชค ตั้งภัสสรเรือง , พิชาภัค อุทัยไพศาลวงศ์ , ดวงใจ แสงสระคู , จันทิมา ชาญประเสริฐ , ทิพวัลย์ อยู่ชา , นุกูล จอมชัย , สม วงษ์ตระกูลรุ่ง . "Characterization of the complete chloroplast genome of Hevea brasiliensis reveals genome rearrangement, RNA editing sites and phylogenetic relationships."
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2554. Print.
Sithichoke Tangphatsornruang , Pichahpuk Uthaipaisanwong , Duangjai Sangsrakru , Juntima Chanprasert , Thippawan Yoocha , Nukoon Jomchai , Somvong Traogonrung , สิทธิโชค ตั้งภัสสรเรือง , พิชาภัค อุทัยไพศาลวงศ์ , ดวงใจ แสงสระคู , จันทิมา ชาญประเสริฐ , ทิพวัลย์ อยู่ชา , นุกูล จอมชัย , สม วงษ์ตระกูลรุ่ง . Characterization of the complete chloroplast genome of Hevea brasiliensis reveals genome rearrangement, RNA editing sites and phylogenetic relationships. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2554.