ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

DNA hybridization enhancement using piezoelectric microagitation through a liquid coupling medium

หน่วยงาน สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : DNA hybridization enhancement using piezoelectric microagitation through a liquid coupling medium
นักวิจัย : Kiattimant Rodaree , Thitima Maturos , Sastra Chaotheing , Tawee Pogfay , Nattida Suwanakitti , Chayapat Wongsombat , Kata Jaruwongrungsee , Anurat Wisitsoraat , Sumalee Kamchonwongpaisan , Tanom Lomas , Adisorn Tuantranont , เกียรติมันต์ รอดอารีย์ , ธิติมา มธุรส , ศาสตรา เช้าเที่ยง
คำค้น : Acoustic streaming , DNA hybridization enhancement , Instruments and techniques , Piezoelectric , ศูนย์พันธุวิศวกรรมและเทคโนโลยีชีวภาพแห่งชาติ
หน่วยงาน : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2554
อ้างอิง : http://www.nstda.or.th/thairesearch/node/13462
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

In conventional DNA microarray hybridization, delivery of target cDNAs to surface-bounded probes depends solely on diffusion, which is notoriously slow, and thus typically requires 6–20 h to complete. In this study, piezoelectricmicroagitation through a liquid couplingmedium is employed to enhanceDNA hybridization efficiency and the results are compared with the standard static hybridization method. DNA hybridization was performed in a sealed aluminium chamber containing DNA microarray glass chip, coupling medium and piezoelectric transducers. 3 SSC (Saline Sodium Citrate) was used as a coupling medium to prevent overheating of the piezoelectric transducers and to effectively transmit ultrasonic wave to the glass chip. Flow visualization using fluidic dye and velocimetry (PTV) technique was applied to observe fluid transport in the hybridization chamber. It was revealed that the dye solution was homogeneously distributedwithin 10min under dynamic agitationwhile it took over 1 h to reach the same level of homogeneity in static condition. PlasmodiumfalciparumDNAmicroarrays and totalRNA extracted from parasite cells were used as a model for DNA microarray experiments. It was found that the required hybridization time may be substantially reduced from 16 h to 4 h by the use of dynamic hybridization scheme.With the same hybridization time of 16 h, dynamic hybridization resulted in higher fluorescent signals of 33% and 24% compared to static hybridization in Cy3 and Cy5 channels, respectively. Additionally, good/effective spots, some of which were not formed by static method, were enhanced and distributed more uniformly over the microarray. Therefore, the developed dynamic hybridization with integrated piezoelectric microagitation platform is highly promising for DNA analysis in molecular biology and medical applications.

บรรณานุกรม :
Kiattimant Rodaree , Thitima Maturos , Sastra Chaotheing , Tawee Pogfay , Nattida Suwanakitti , Chayapat Wongsombat , Kata Jaruwongrungsee , Anurat Wisitsoraat , Sumalee Kamchonwongpaisan , Tanom Lomas , Adisorn Tuantranont , เกียรติมันต์ รอดอารีย์ , ธิติมา มธุรส , ศาสตรา เช้าเที่ยง . (2554). DNA hybridization enhancement using piezoelectric microagitation through a liquid coupling medium.
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Kiattimant Rodaree , Thitima Maturos , Sastra Chaotheing , Tawee Pogfay , Nattida Suwanakitti , Chayapat Wongsombat , Kata Jaruwongrungsee , Anurat Wisitsoraat , Sumalee Kamchonwongpaisan , Tanom Lomas , Adisorn Tuantranont , เกียรติมันต์ รอดอารีย์ , ธิติมา มธุรส , ศาสตรา เช้าเที่ยง . 2554. "DNA hybridization enhancement using piezoelectric microagitation through a liquid coupling medium".
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ.
Kiattimant Rodaree , Thitima Maturos , Sastra Chaotheing , Tawee Pogfay , Nattida Suwanakitti , Chayapat Wongsombat , Kata Jaruwongrungsee , Anurat Wisitsoraat , Sumalee Kamchonwongpaisan , Tanom Lomas , Adisorn Tuantranont , เกียรติมันต์ รอดอารีย์ , ธิติมา มธุรส , ศาสตรา เช้าเที่ยง . "DNA hybridization enhancement using piezoelectric microagitation through a liquid coupling medium."
    ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ, 2554. Print.
Kiattimant Rodaree , Thitima Maturos , Sastra Chaotheing , Tawee Pogfay , Nattida Suwanakitti , Chayapat Wongsombat , Kata Jaruwongrungsee , Anurat Wisitsoraat , Sumalee Kamchonwongpaisan , Tanom Lomas , Adisorn Tuantranont , เกียรติมันต์ รอดอารีย์ , ธิติมา มธุรส , ศาสตรา เช้าเที่ยง . DNA hybridization enhancement using piezoelectric microagitation through a liquid coupling medium. ปทุมธานี : สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ; 2554.