เมื่อเทียบกับพืชชนิดอื่นแล้วการศึกษาระบบหน้าที่ของยีนในพืชเศรษฐกิจที่ สำคัญอย่างมันสำปะหลังนั้นยังถือว่าอยู่เพียงแค่ขั้นเริ่มต้น ซึ่งการขาดความรู้ความเข้าใจอย่างถ่องแท้ในระบบเครือข่ายของยีนต่างๆที่ควบคุมขั้นตอนต่างๆของการสร้างแป้งนั้นเป็นอุปสรรคหลักที่ส่งผลให้เกิดความล่าช้าในการพัฒนากรรมวิธีทางชีวภาพขึ้นมาเป็นทางเลือกใหม่ในการปรับปรุง คุณสมบัติทั้งด้านปริมาณและคุณภาพของแป้งมันสำปะหลังเพื่อทดแทนกรรมวิธีการ ดัดแปลงคุณสมบัติแป้งทางเคมีและกายภาพที่ใช้ในปัจจุบันซึ่งส่วนใหญ่นั้น สร้างผลเสียต่อสิ่งแวดล้อม การพัฒนาระบบกลไกและเทคนิคต่างๆเพื่อการศึกษาระบบหน้าที่ของยีนที่มีความก้าวหน้าไปอย่างรวดเร็วนั้นเป็นประโยชน์อย่างสูงต่อความรู้ความเข้าใจในระบบ เครือข่ายของยีนที่ควบคุมลักษณะที่แสดงออกที่สำคัญต่างๆในสิ่งมีชีวิตหลาย ประเภทรวมทั้งพืช ในการศึกษานี้จะมีความร่วมมือระหว่างหน่วยงานศูนย์พันธุวิศวกรรมและ เทคโนโลยีแห่งชาติกับกับหน่วยงานวิจัยที่ NARA Institute of Science and technology เพื่อเป้าหมายในการสร้างฐานข้อมูล EST ขนาดใหญ่ของมันสำปะหลัง ซึ่งในขั้นต้นข้อมูล EST ที่ได้นั้นจะมีประโยชน์ในการช่วยบ่งบอกถึงสถานะและการเปลี่ยนแปลงของระบบ transcriptome ของมันสำปะหลังภายใต้สภาวะและตัวแปรที่มีผลต่อระบบเมทาบอลิสมของแป้งในพืช และภายหลังจากการวิเคราะห์ฐานข้อมูล EST ที่ได้อย่างละเอียด EST sequence จะถูกคัดเลือกเพื่อใช้ในการสร้าง microarray chip ของมันสำปะหลัง สำหรับการศึกษาการเปลี่ยนแปลงในระบบการแสดงออกของยีนต่างๆในรากมันสำปะหลัง เพื่อเป้าหมายในการค้นหายีนที่สำคัญที่ทำหน้าที่ควบคุมขั้นตอนต่างๆในระบบเมตาบอลิสมของการสร้างแป้งในรากมันสำปะหลัง