ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

การศึกษาลักษณะสมบัติของเปปไทด์ต้านจุลชีพในปูทะเล (Scylla paramamosain)

หน่วยงาน สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : การศึกษาลักษณะสมบัติของเปปไทด์ต้านจุลชีพในปูทะเล (Scylla paramamosain)
นักวิจัย : จันทร์ประภา อิ่มจงใจรัก
คำค้น : antimicrobial peptide , crustin , Scylla paramamosain , ปูทะเล , ลักษณะสมบัติ , เปปไทด์ต้านจุลชีพ
หน่วยงาน : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2553
อ้างอิง : http://elibrary.trf.or.th/project_content.asp?PJID=MRG5180196 , http://research.trf.or.th/node/3102
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

ในงานวิจัยนี้ได้ทำการค้นหาลำดับนิวคลีโอไทด์ที่สมบูรณ์ (full length cDNA) ของยีนเปปไทด์ต้านจุลชีพครัสติน (CrusSp) ศึกษาลักษณะสมบัติของยีน รวมทั้งแยกและวิเคราะห์การจัดเรียงตัวของยีน(genomic organization) จากการค้นหาลำดับนิวคลีโอไทด์ที่สมบูรณ์ของยีนเปปไทด์ต้านจุลชีพครัสตินจากเซลล์เม็ดเลือดของปูทะเล (Scylla paramamosain) โดยเทคนิค rapid amplification cDNA end (RACE)พบว่าประกอบด้วย ORF ขนาด 336 bp ที่สามารถถอดรหัสให้กรดอะมิโน 111 ตัว โดยมี signal peptide21 ตัว เมื่อนำมาคำนวณมวลโมเลกุลของโปรตีนพบว่ามีขนาดประมาณ 10.27 kDa และมีค่า pI 8.54 จากการวิเคราะห์โดเมนของโปรตีน CrusSp พบว่าที่บริเวณปลาย C ประกอบด้วย whey acidic protein(WAP) domain จากการเปรียบเทียบลำดับกรดอะมิโนและการวิเคราะห์ความสัมพันธ์เชิงวิวัฒนาการพบว่ายีน CrusSp ที่แยกได้มีความคล้ายกับกลุ่มของยีนครัสตินโดยมีความสัมพันธ์ใกล้ชิดกับเปปไทด์ต้านจุลชีพครัสตินที่พบในปู Carcinus maenas จากการแยกและวิเคราะห์การจัดเรียงตัวของยีนพบว่ายีน CrusSpมีขนาด 999 bpซึ่งประกอบด้วย 4 exon และ 3 intron โดยในบริเวณรอยต่อระหว่าง exon และ intronเป็นไปตาม GT/AG rule เมื่อตรวจสอบการแสดงออกของยีน CrusSp ในเนื้อเยื่อต่าง ๆ ของปูทะเล พบว่ายีน CrusSp มีการแสดงออกอย่างมากในเซลล์เม็ดเลือด เหงือก ลำไส้ และกล้ามเนื้อ แต่ไม่พบการแสดงออกในตับและก้านตา เมื่อนำยีน CrusSp มาศึกษาการแสดงออกใน Escherichia coli พบว่าสามารถเหนี่ยวนำให้มีการแสดงออกของโปรตีนรีคอมบิแนนท์ได้ เมื่อนำมาแยกบริสุทธิ์และตรวจสอบคุณสมบัติการต้านเชื้อจุลชีพพบว่าโปรตีน CrusSp มีฤทธิ์ในการต้านเชื้อแบคทีเรียแกรมบวกได้ In this study, we report the identification and characterization of a crustin (CrusSp) from the hemocyte of mud crab, Scylla paramamosain using rapid amplification cDNA end (RACE) approach. Analysis of the nucleotide sequence revealed seven different variances of the CrusSp cDNA in mud crab. The open reading frame encodes a protein of 111 amino acids with 21 residues signal sequence. The predicted molecular mass of the mature protein (90 amino acids) is 10.27 kDa with an estimated pI of 8.54. Analysis of the protein domain features indicated typical conserved cysteine residues containing a single WAP domain at the C-terminus. A neighbour-joining tree showed that S. paramamosain crustin is closely related to other crustin homologues, and displays the highest similarity to crustin antimicrobial peptide in shore crab Carcinus maenas. Four exons and three introns were identified within the 999 bp genomic DNA sequence of CrusSp. Tissue distribution analysis showed that CrusSp was highly expressed in hemocytes, gills, intestines and muscle but it was not expressed in hepatopancreas and eyestalks. To gain insight into the in vitro antimicrobial activities of CrusSp, the mature peptide coding region was cloned into Escherichia coli for heterologous expression. The recombinant CrusSp could inhibit the growth of gram-positive bacteria but had no inhibition activity against gram-negative bacteria

บรรณานุกรม :
จันทร์ประภา อิ่มจงใจรัก . (2553). การศึกษาลักษณะสมบัติของเปปไทด์ต้านจุลชีพในปูทะเล (Scylla paramamosain).
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
จันทร์ประภา อิ่มจงใจรัก . 2553. "การศึกษาลักษณะสมบัติของเปปไทด์ต้านจุลชีพในปูทะเล (Scylla paramamosain)".
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
จันทร์ประภา อิ่มจงใจรัก . "การศึกษาลักษณะสมบัติของเปปไทด์ต้านจุลชีพในปูทะเล (Scylla paramamosain)."
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย, 2553. Print.
จันทร์ประภา อิ่มจงใจรัก . การศึกษาลักษณะสมบัติของเปปไทด์ต้านจุลชีพในปูทะเล (Scylla paramamosain). กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย; 2553.