ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของไวรัสพีอาร์อาร์เอสในสุกร ในประเทศไทย

หน่วยงาน สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของไวรัสพีอาร์อาร์เอสในสุกร ในประเทศไทย
นักวิจัย : รุ่งโรจน์ ธนาวงษ์นุเวช
คำค้น : -
หน่วยงาน : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2546
อ้างอิง : http://elibrary.trf.or.th/project_content.asp?PJID=PDF4480027 , http://research.trf.or.th/node/694
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

ตัวอย่างไวรัสพีอาร์อาร์เอส จำนวนทั้งหมด 137 ตัวอย่าง จากงานบริการของหน่วยชันสูตรโรคสัตว์ คณะสัตวแพทย์ศาสตร์ จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย ได้รับการทดสอบยืนยันการปรากฏตัวของไวรัสโดยใช้ Monoclonal antibody ( SDOW-17 ) และยืนยันชนิดของสายพันธุ์โดยวิธี nested multiplex RT-PCR ( nm RT-PCr ) ของ ORF – 1b สามารถจำแนกสายพันธุ์ได้เป็นสายพันธุ์อเมริกา ( US ) จำนวน 46 ตัวอย่าง ๖ 28.97%) และสายพันธุ์ยุโรป ( EU ) จำนวน 91 ตัวอย่าง ( 71.03% ) โดยใช้ไวรัสควบคุม SV125 ( US strain ) สำหรับสายพันธุ์ US และ Le;ystad virus สำหรับสายพันธุ์ EU รวมทั้งได้ทดสอบความไวของ nm RT-PCR พบว่าสามารถตรวจพบไวรัสที่ปริมาณไดเตอร์น้อยที่สุดน้อยกว่า 10 1 TCID50 / ml ทำการคัดเลือกกลุ่มตัวอย่างของทั้งสองสายพันธุ์ เพื่อนำมาตรวจหาการเรียงตัวของลำดับเบสของ ORF-5 พบว่าตัวอย่างไวรัสพีอาร์อาร์เอส สายพันธุ์อเมริกาที่แยกได้ในเมืองไทย ( 00CS1 , 01NP1 , 01UD6 , 02CB13 , 02KK1 , 02PB1 , 02SP2 และ 02SP3 )มีสายพันธุกรรมใกล้เคียงกับ ไวรัสพีอาร์อาร์เอสที่แยกได้จากประเทศแคนาดา ( IAF-EXP91 ) ส่วนตัวอย่างไวรัสพีอาร์อาร์เอส สายพันธุ์ยุโรป ( 01CB1 , 01RB1 , 02BR1 , 02CB12 , 02SB2 และ 03RB1 )มีสายพันธุกรรมใกล้เคียงกับ ไวรัสพีอาร์อาร์เอส ต้นแบบ ( Lelystad virus ) บ่งบอกถึงการระบาดของไวรัสพีอาร์อาร์เอสในประเทศไทยอาจมาจากการนำเข้าสุกรพันธุ์จากประเทศดังกล่าวนอกจากนี้พบว่าการกระจายของไวรัสพีอาร์อาร์เอสในแต่ละท้องที่ไม่ขึ้นอยู่กับภูมิประเทศเนื่องจากมีความเหมือนของไวรัสพีอาร์อาร์เอสที่แยกได้แต่ละท้องที่ที่ห่างไกลกัน ไวรัสพีอาร์อาร์เอสสายพันธุ์ EU 02CB12 มีความเหมือนของการเรียงตัวของลำดับเบสของ ORF5 มากกว่า 99% กับไวรัสวัคซีน ( Porcillis ) ที่ยังไม่เคยมีรายงานการใช้ในประเทศไทย ไม่พบ genetic recombination ของทั้งสองสายพันธุ์ The Thai isolates of porcine reproductive and respiratory syndrome virus ( PRRSV ) were obtained from the Chulalongkorn University-Veterinary Diagnostic Laboratory ( CU-VDL 0. Virus isolation was confirmed by immunoperoxidase monolayer assay ( IPMA ) using SDOW-17. The virus genotype was determined using nested multiplex RT-PCR ( nm RT-PCR ) of ORF-1b. SV1275 ( US genotype ) and Lelystad virus ( EU genotype ) were used as the positive control. The nm RT-PCR was able to detect at least 101 TCID 50/ml of PRRSV. Of 137 Thai isolates , 71.03% belonged to the European genotype and 28.97% was the US genotype. ORF-5 products of the US strain ( 00CS1 , 01NP1,01UD6,02CB13,02KK1,02PB1,02SP2 and 02SP3 ) and the EU strain ( 01CB1,01RB1,02RB1,02CB12,02SB2 and 03RB1 ) WERE amplified for DNA sequencing. The US strains of the Thai isolates are clustered within the same group and are more closely related to the IAF-EXP91 from Canada ( 89 – 90% nucleotide identity ) , whereas the EU strains were very similar to the EU prototype , Lelystad virus ( 87 – 97% nucleotide identity ) The ORF5 nucleotide identities within the US genotype tested in this study compared with the US prototype, VR-2332 varied from 83.7 – 85.2% , whereas 83.5 – 85.5% amino acid identites were found. Based on the phylogenetic tree, each pair of the Thai isolates ( 01NP1 and 02KK1 , 00CS1 and 01UD6 , and 01CB1 and 01RB1 ) were identical , despite they were from different provinces. Therefore , there was no geographic influence on the spreading of PRRSV in Thailand. Interestingly , 02CB12 ( EU ) shared over 99% similarity of the ORF-5 nucleotide sequence and 98.6% of amino acid identity with the Porcillis vaccine ( AF378819 ). No evidence of genetic recombination between the two genotypes was found in this study.

บรรณานุกรม :
รุ่งโรจน์ ธนาวงษ์นุเวช . (2546). การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของไวรัสพีอาร์อาร์เอสในสุกร ในประเทศไทย.
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
รุ่งโรจน์ ธนาวงษ์นุเวช . 2546. "การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของไวรัสพีอาร์อาร์เอสในสุกร ในประเทศไทย".
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย.
รุ่งโรจน์ ธนาวงษ์นุเวช . "การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของไวรัสพีอาร์อาร์เอสในสุกร ในประเทศไทย."
    กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย, 2546. Print.
รุ่งโรจน์ ธนาวงษ์นุเวช . การศึกษาความหลากหลายทางพันธุกรรมของไวรัสพีอาร์อาร์เอสในสุกร ในประเทศไทย. กรุงเทพมหานคร : สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย; 2546.