ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Direct folding simulation of a long helix in explicit water

หน่วยงาน Nanyang Technological University, Singapore

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Direct folding simulation of a long helix in explicit water
นักวิจัย : Gao, Ya , Lu, Xiaoliang , Duan, Lili , Zhang, Dawei , Mei, Ye , Zhang, John Z. H.
คำค้น : -
หน่วยงาน : Nanyang Technological University, Singapore
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2556
อ้างอิง : Gao, Y., Lu, X., Duan, L., Zhang, D., Mei, Y.,& Zhang, J. Z. H. (2013). Direct folding simulation of a long helix in explicit water. Applied Physics Letters, 102(19), 193706. , 0003-6951 , http://hdl.handle.net/10220/13304 , http://dx.doi.org/10.1063/1.4807145
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : Applied physics letters
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

A recently proposed Polarizable Hydrogen Bond (PHB) method has been employed to simulate the folding of a 53 amino acid helix (PDB ID 2KHK) in explicit water. Under PHB simulation, starting from a fully extended structure, the peptide folds into the native state as confirmed by measured time evolutions of radius of gyration, root mean square deviation (RMSD), and native hydrogen bond. Free energy and cluster analysis show that the folded helix is thermally stable under the PHB model. Comparison of simulation results under, respectively, PHB and standard nonpolarizable force field demonstrates that polarization is critical for stable folding of this long α-helix.

บรรณานุกรม :
Gao, Ya , Lu, Xiaoliang , Duan, Lili , Zhang, Dawei , Mei, Ye , Zhang, John Z. H. . (2556). Direct folding simulation of a long helix in explicit water.
    กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore.
Gao, Ya , Lu, Xiaoliang , Duan, Lili , Zhang, Dawei , Mei, Ye , Zhang, John Z. H. . 2556. "Direct folding simulation of a long helix in explicit water".
    กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore.
Gao, Ya , Lu, Xiaoliang , Duan, Lili , Zhang, Dawei , Mei, Ye , Zhang, John Z. H. . "Direct folding simulation of a long helix in explicit water."
    กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore, 2556. Print.
Gao, Ya , Lu, Xiaoliang , Duan, Lili , Zhang, Dawei , Mei, Ye , Zhang, John Z. H. . Direct folding simulation of a long helix in explicit water. กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore; 2556.