ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Hypercomplex cross-correlation of DNA sequences

หน่วยงาน Nanyang Technological University, Singapore

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Hypercomplex cross-correlation of DNA sequences
นักวิจัย : Shu, Jian Jun , Li, Yajing
คำค้น : DRNTU::Engineering::Bioengineering.
หน่วยงาน : Nanyang Technological University, Singapore
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2553
อ้างอิง : Shu, J. J., & Li, Y. (2010). Hypercomplex Cross-Correlation of DNA Sequences. Journal of Biological Systems, 18(4), 711-725. , 0218-3390 , http://hdl.handle.net/10220/7119 , http://dx.doi.org/10.1142/S0218339010003470 , 148765
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : Journal of biological systems
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

A hypercomplex representation of DNA is proposed to facilitate comparing DNA sequences with fuzzy composition. With the hypercomplex number representation, the conventional sequence analysis method, such as, dot matrix analysis, dynamic programming, and cross-correlation method have been extended and improved to align DNA sequences with fuzzy composition. The hypercomplex dot matrix analysis can provide more control over the degree of alignment desired. A new scoring system has been proposed to accommodate the hypercomplex number representation of DNA and integrated with dynamic programming alignment method. By using hypercomplex cross-correlation, the match and mismatch alignment information between two aligned DNA sequences are separately stored in the resultant real part and imaginary parts respectively. The mismatch alignment information is very useful to refine consensus sequence based motif scanning.

บรรณานุกรม :
Shu, Jian Jun , Li, Yajing . (2553). Hypercomplex cross-correlation of DNA sequences.
    กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore.
Shu, Jian Jun , Li, Yajing . 2553. "Hypercomplex cross-correlation of DNA sequences".
    กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore.
Shu, Jian Jun , Li, Yajing . "Hypercomplex cross-correlation of DNA sequences."
    กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore, 2553. Print.
Shu, Jian Jun , Li, Yajing . Hypercomplex cross-correlation of DNA sequences. กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore; 2553.