ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Improved lower bounds for constant GC-content DNA codes

หน่วยงาน Nanyang Technological University, Singapore

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Improved lower bounds for constant GC-content DNA codes
นักวิจัย : Chee, Yeow Meng , Ling, San
คำค้น : DRNTU::Science::Mathematics::Applied mathematics
หน่วยงาน : Nanyang Technological University, Singapore
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2551
อ้างอิง : Chee, Y. M., & Ling, S. (2008). Improved lower bounds for constant GC-content DNA codes. IEEE Transactions on Information Theory, 54(1), 391-394. , 0018-9448 , http://hdl.handle.net/10220/6033 , http://sfxna09.hosted.exlibrisgroup.com:3410/ntu/sfxlcl3?sid=metalib:EBSCO_APH&id=doi:&genre=&isbn=&issn=00189448&date=2008&volume=54&issue=1&spage=391&epage=394&aulast=Yeow&aufirst=Meng%20Chee&auinit=&title=IEEE%20Transactions%20on%20Information%20Theory&atitle=Improved%20Lower%20Bounds%20for%20Constant%20GC%2DContent%20DNA%20Codes%2E , http://dx.doi.org/10.1109/TIT.2007.911167
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : IEEE transactions on information theory
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

The design of large libraries of oligonucleotides having constant GC-content and satisfying Hamming distance constraints between oligonucleotides and their Watson-Crick complements is important in reducing hybridization errors in DNA computing, DNA microarray technologies, and molecular bar coding. Various techniques have been studied for the construction of such oligonucleotide libraries, ranging from algorithmic constructions via stochastic local search to theoretical constructions via coding theory. A new stochastic local search method is introduced, which yields improvements for more than one third of the benchmark lower bounds of Gaborit and King (2005) for n-mer oligonucleotide libraries when n ≤14. Several optimal libraries are also found by computing maximum cliques on certain graphs.

บรรณานุกรม :
Chee, Yeow Meng , Ling, San . (2551). Improved lower bounds for constant GC-content DNA codes.
    กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore.
Chee, Yeow Meng , Ling, San . 2551. "Improved lower bounds for constant GC-content DNA codes".
    กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore.
Chee, Yeow Meng , Ling, San . "Improved lower bounds for constant GC-content DNA codes."
    กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore, 2551. Print.
Chee, Yeow Meng , Ling, San . Improved lower bounds for constant GC-content DNA codes. กรุงเทพมหานคร : Nanyang Technological University, Singapore; 2551.