ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Combined quantum-mechanics/molecular-mechanics dynamics simulation of A-DNA double strands irradiated by ultra-low-energy carbon ions

หน่วยงาน มหาวิทยาลัยเชียงใหม่

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Combined quantum-mechanics/molecular-mechanics dynamics simulation of A-DNA double strands irradiated by ultra-low-energy carbon ions
นักวิจัย : Ngaojampa C. , Nimmanpipug P. , Yu L. , Anuntalabhochai S. , Lee V.
คำค้น : -
หน่วยงาน : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2554
อ้างอิง : 0168583X , 2-s2.0-79251532379 , 10.1016/j.nimb.2010.12.069 , https://www.scopus.com/inward/record.uri?partnerID=HzOxMe3b&scp=79251532379&origin=inward , http://cmuir.cmu.ac.th/jspui/handle/6653943832/43102
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

In order to promote understanding of the fundamentals of ultra-low-energy ion interaction with DNA, molecular dynamics simulations using combined quantum-mechanics/molecular-mechanics of poly-AT and poly-GC A-DNA double strands irradiated by < 200 eV carbon ions were performed to investigate the molecular implications of mutation bias. The simulations were focused on the responses of the DNA backbones and nitrogenous bases to irradiation. Analyses of the root mean square displacements of the backbones and non-hydrogen atoms of base rings of the simulated DNA structure after irradiation revealed a potential preference of DNA double strand separation, dependent on the irradiating energy. The results show that for the backbones, the large difference in the displacement between poly-GC and poly-AT in the initial time period could be the reason for the backbone breakage; for the nitrogenous base pairs, A-T is 30% more sensitive or vulnerable to ion irradiation than G-C, demonstrating a preferential, instead of random, effect of irradiation-induced mutation. © 2010 Elsevier B.V. All rights reserved.

บรรณานุกรม :
Ngaojampa C. , Nimmanpipug P. , Yu L. , Anuntalabhochai S. , Lee V. . (2554). Combined quantum-mechanics/molecular-mechanics dynamics simulation of A-DNA double strands irradiated by ultra-low-energy carbon ions.
    เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ .
Ngaojampa C. , Nimmanpipug P. , Yu L. , Anuntalabhochai S. , Lee V. . 2554. "Combined quantum-mechanics/molecular-mechanics dynamics simulation of A-DNA double strands irradiated by ultra-low-energy carbon ions".
    เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ .
Ngaojampa C. , Nimmanpipug P. , Yu L. , Anuntalabhochai S. , Lee V. . "Combined quantum-mechanics/molecular-mechanics dynamics simulation of A-DNA double strands irradiated by ultra-low-energy carbon ions."
    เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ , 2554. Print.
Ngaojampa C. , Nimmanpipug P. , Yu L. , Anuntalabhochai S. , Lee V. . Combined quantum-mechanics/molecular-mechanics dynamics simulation of A-DNA double strands irradiated by ultra-low-energy carbon ions. เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ ; 2554.