ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

A novel multiplex RT-PCR for identification of VP6 subgroups of human and porcine rotaviruses

หน่วยงาน มหาวิทยาลัยเชียงใหม่

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : A novel multiplex RT-PCR for identification of VP6 subgroups of human and porcine rotaviruses
นักวิจัย : Thongprachum A. , Chaimongkol N. , Khamrin P. , Pantip C. , Mizuguchi M. , Ushijima H. , Maneekarn N.
คำค้น : -
หน่วยงาน : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2553
อ้างอิง : 1660934 , 10.1016/j.jviromet.2010.05.013 , 20546787 , JVMED , http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-77955097047&partnerID=40&md5=a0f943a31409771260739aef98c8daf5 , http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20546787 , http://cmuir.cmu.ac.th/handle/6653943832/2548
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

VP6 protein antigens allow classification of rotaviruses into at least four subgroups, depending on the presence or absence of SG-specific epitopes: SG I, SG II, SG (I. +. II), and SG non-(I. +. II). However, MAbs against epitopes on the VP6 protein of human and porcine rotaviruses, sometimes, do not recognize SG-specific epitopes or recognize irrelevant-SG epitopes and therefore result in the incorrect assignment of subgroups. In order to solve this problem, a novel multiplex RT-PCR was developed as an alternative tool to identify VP6 genogroups using newly designed primers which are specific for genogroup I or II. The sensitivity and specificity of the newly developed multiplex RT-PCR method was evaluated by testing with human and porcine rotaviruses of known SG I, SG II, SG (I. +. II), and SG non-(I. +. II) strains in comparison with monoplex RT-PCR and VP6 sequence analysis. The results show that the genogroups of both human and porcine rotaviruses as determined by the new multiplex RT-PCR method were in 100% agreement with those determined by monoplex RT-PCR and VP6 sequence analysis. The method was shown to be specific, sensitive, less-time consuming, and successful in genogrouping clinical isolates of rotaviruses circulating in children and piglets with acute diarrhea. © 2010 Elsevier B.V.

บรรณานุกรม :
Thongprachum A. , Chaimongkol N. , Khamrin P. , Pantip C. , Mizuguchi M. , Ushijima H. , Maneekarn N. . (2553). A novel multiplex RT-PCR for identification of VP6 subgroups of human and porcine rotaviruses.
    เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ .
Thongprachum A. , Chaimongkol N. , Khamrin P. , Pantip C. , Mizuguchi M. , Ushijima H. , Maneekarn N. . 2553. "A novel multiplex RT-PCR for identification of VP6 subgroups of human and porcine rotaviruses".
    เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ .
Thongprachum A. , Chaimongkol N. , Khamrin P. , Pantip C. , Mizuguchi M. , Ushijima H. , Maneekarn N. . "A novel multiplex RT-PCR for identification of VP6 subgroups of human and porcine rotaviruses."
    เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ , 2553. Print.
Thongprachum A. , Chaimongkol N. , Khamrin P. , Pantip C. , Mizuguchi M. , Ushijima H. , Maneekarn N. . A novel multiplex RT-PCR for identification of VP6 subgroups of human and porcine rotaviruses. เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ ; 2553.