ridm@nrct.go.th   ระบบคลังข้อมูลงานวิจัยไทย   รายการโปรดที่คุณเลือกไว้

Novel porcine rotavirus of genotype P[27] shares new phylogenetic lineage with G2 porcine rotavirus strain

หน่วยงาน มหาวิทยาลัยเชียงใหม่

รายละเอียด

ชื่อเรื่อง : Novel porcine rotavirus of genotype P[27] shares new phylogenetic lineage with G2 porcine rotavirus strain
นักวิจัย : Khamrin P. , Maneekarn N. , Peerakome S. , Chan-it W. , Yagyu F. , Okitsu S. , Ushijima H.
คำค้น : -
หน่วยงาน : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่
ผู้ร่วมงาน : -
ปีพิมพ์ : 2550
อ้างอิง : 00426822 , 10.1016/j.virol.2006.12.004 , 17215015 , VIRLA , http://www.scopus.com/inward/record.url?eid=2-s2.0-34147100742&partnerID=40&md5=d0bd582221e7099dc31a5c53223d1a51 , http://cmuir.cmu.ac.th/handle/6653943832/2209
ที่มา : -
ความเชี่ยวชาญ : -
ความสัมพันธ์ : -
ขอบเขตของเนื้อหา : -
บทคัดย่อ/คำอธิบาย :

A novel and unusual strain of porcine rotavirus (PoRV) CMP034 was isolated from a 7-week-old piglet during the epidemiological survey of porcine rotavirus infection in Chiang Mai province, Thailand from June 2000 to July 2001. Molecular characterization of gene VP4 by sequence analysis showed a low level of amino acid sequence identity, ranging from 56.7% to 76.6%, while comparison of VP8* portion showed 41.8% to 69.9% identity, with the 26 P genotypes recognized to date. Phylogenetic analysis of the VP4 sequence revealed that CMP034 was only distantly related to the other 26 P genotypes and was located in a separate branch. Sequence analysis of gene VP7 showed the highest level of amino acid identity (94.7%) with the PoRV G2-like reference strain 34461-4 but a lower level of identity with those of human G2 rotaviruses, ranging from 87.7% to 88.0%. Phylogenetic analysis of gene VP7 revealed two major lineages among G2 rotavirus strains based on the host origin. PoRV strain CMP034 clustered exclusively with G2-like PoRV strain 34461-4 in a novel lineage that is distinct from the major G2 human lineage. Moreover, strain CMP034 displayed a porcine-like VP6 and NSP5/6 with subgroup I specificity, while bearing an NSP4 with some genetic group B human-like characteristics. These findings provide evidence that CMP034 should be considered as a novel VP4 genotype P[27]. © 2006 Elsevier Inc. All rights reserved.

บรรณานุกรม :
Khamrin P. , Maneekarn N. , Peerakome S. , Chan-it W. , Yagyu F. , Okitsu S. , Ushijima H. . (2550). Novel porcine rotavirus of genotype P[27] shares new phylogenetic lineage with G2 porcine rotavirus strain.
    เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ .
Khamrin P. , Maneekarn N. , Peerakome S. , Chan-it W. , Yagyu F. , Okitsu S. , Ushijima H. . 2550. "Novel porcine rotavirus of genotype P[27] shares new phylogenetic lineage with G2 porcine rotavirus strain".
    เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ .
Khamrin P. , Maneekarn N. , Peerakome S. , Chan-it W. , Yagyu F. , Okitsu S. , Ushijima H. . "Novel porcine rotavirus of genotype P[27] shares new phylogenetic lineage with G2 porcine rotavirus strain."
    เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ , 2550. Print.
Khamrin P. , Maneekarn N. , Peerakome S. , Chan-it W. , Yagyu F. , Okitsu S. , Ushijima H. . Novel porcine rotavirus of genotype P[27] shares new phylogenetic lineage with G2 porcine rotavirus strain. เชียงใหม่ : มหาวิทยาลัยเชียงใหม่ ; 2550.